Biopython : Alignement de plusieurs sequences deux fichier fasta

[East]

Bonjour,

 

J'ai un projet de fin d'année a rendre pour bientôt et pour se projet je dois trouver les 10 sites de liaison à l'ATP humain qui se rapproche le plus de 7 sites de liaison à l'ATP du plasmodium. Je possède actuellement 135 site de liaison a l'ATP dans un fichier fasta et mes 7 séquences du plasmodium sont dans un autre fichier fasta. J’aimerai donc crée une fonction qui comparerait chaque séquence humaine aux 7 sequences du plasmodium et qui me renverrait les 10 séquences humaine les plus proche. J'avais pour idée d'utiliser les baise pair aligment de Biopython mais je sais pas comment coder une telle fonction.

J'attends votre aide avec impatience .

 

Mercii beaucoup