Aller au contenu
East

Biopython : Alignement de plusieurs sequences deux fichier fasta

Messages recommandés

Bonjour,

 

J'ai un projet de fin d'année a rendre pour bientôt et pour se projet je dois trouver les 10 sites de liaison à l'ATP humain qui se rapproche le plus de 7 sites de liaison à l'ATP du plasmodium. Je possède actuellement 135 site de liaison a l'ATP dans un fichier fasta et mes 7 séquences du plasmodium sont dans un autre fichier fasta. J’aimerai donc crée une fonction qui comparerait chaque séquence humaine aux 7 sequences du plasmodium et qui me renverrait les 10 séquences humaine les plus proche. J'avais pour idée d'utiliser les baise pair aligment de Biopython mais je sais pas comment coder une telle fonction.

J'attends votre aide avec impatience .

 

Mercii beaucoup

Partager ce message


Lien à poster
Partager sur d’autres sites

Join the conversation

You can post now and register later. If you have an account, sign in now to post with your account.

Invité
Répondre à ce sujet…

×   Collé en tant que texte enrichi.   Coller en tant que texte brut à la place

  Seulement 75 émoticônes maximum sont autorisées.

×   Votre lien a été automatiquement intégré.   Afficher plutôt comme un lien

×   Votre contenu précédent a été rétabli.   Vider l’éditeur

×   Vous ne pouvez pas directement coller des images. Envoyez-les depuis votre ordinateur ou insérez-les depuis une URL.

Chargement

×
×
  • Créer...