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Synthèse Peptidique


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13 réponses à ce sujet

#1 Su Princess

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Posté 28 novembre 2011 - 15:41

Bonjour

J'ai fait un exercice et je voudrais savoir si mes formules chimiques sont correctes et bien dessinées.
Pourriez vous regarder, s'il vous plait?

Voici l'exercice et mon travail:
La cystéine est un acide ∝-aminé de formule semi-développée :
Image IPB
1) Nommer les groupes fonctionnels qui interviennent pour former un dipeptide.
Acide :-COOH ; amine :NH2

2) Repérer l'atome de carbone asymétrique.
1 atome carbone asymétrique :-CH
  Image IPB

3) Dessiner en projection de Fischer la configuration de la D-cystéine.
Image IPB
Un mélange équimolaire de cystéine et d'alanine permet par réaction de condensation d'obtenir des dipeptides.
L'alanine a pour formule semi-développée :
Image IPB

4) Recopier et compléter l'équation de réaction de condensation suivante en ne précisant la formation que d'un seul dipeptide :

Image IPB

Image IPB

On considère maintenant le dipeptide suivant :

Image IPB
5) Identifier la liaison peptidique
Image IPB
6) Écrire les formules semi-développées des acides ∝-aminés mis en jeu dans la synthèse de ce dipeptide
Image IPB
Désolée pour toutes les images, je n'ai pas le choix.

#2 Boltzmann_Solver

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Posté 29 novembre 2011 - 22:59

Bonsoir,

Je t'aiderai ce week-end si personne ne s'y colle avant. Là, je suis overbooké.
Si vous cherchez une correction, précisez le s'il vous plait.
CQFD : Ce Qu'il Fallait Démonter, app : appartient, sqrt = square root = racine carré. Par avance : Errare humanum est, perseverare diabolicum
Les sciences n'essaient pas d'expliquer ; c'est tout juste si elles tentent d'interpréter ; elles font essentiellement des modèles. Par modèle, on entend une construction mathématique qui, à l'aide de certaines interprétations verbales, décrit les phénomènes observés. La justification d'une telle construction mathématique réside uniquement et précisément dans le fait qu'elle est censée fonctionner.    -+- Johann von Neumann -+-

#3 Su Princess

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Posté 30 novembre 2011 - 08:28

Bonjour Boltzmann
Merci beaucoup.

Sa veut dire quoi "je suis overbooké"?

#4 Boltzmann_Solver

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Posté 03 décembre 2011 - 11:07

Voir le messageSu Princess, le 28 novembre 2011 - 15:41, dit :

Bonjour

J'ai fait un exercice et je voudrais savoir si mes formules chimiques sont correctes et bien dessinées.
Pourriez vous regarder, s'il vous plait?

Voici l'exercice et mon travail:
La cystéine est un acide ∝-aminé de formule semi-développée :
Image IPB
1) Nommer les groupes fonctionnels qui interviennent pour former un dipeptide.
Acide :-COOH ; amine :NH2

2) Repérer l'atome de carbone asymétrique.
1 atome carbone asymétrique :-CH
  Image IPB

3) Dessiner en projection de Fischer la configuration de la D-cystéine.
Image IPB
Un mélange équimolaire de cystéine et d'alanine permet par réaction de condensation d'obtenir des dipeptides.
L'alanine a pour formule semi-développée :
Image IPB

4) Recopier et compléter l'équation de réaction de condensation suivante en ne précisant la formation que d'un seul dipeptide :

Image IPB

Image IPB

On considère maintenant le dipeptide suivant :

Image IPB
5) Identifier la liaison peptidique
Image IPB
6) Écrire les formules semi-développées des acides ∝-aminés mis en jeu dans la synthèse de ce dipeptide
Image IPB
Désolée pour toutes les images, je n'ai pas le choix.

Bonjour,

overbooké est un néologisme anglais qui provient de l'aviation civil. Cette action consiste à prendre plus de passager que de place afin de limiter les pertes par annulation.

Maintenant, on utilise aussi ce terme a été introduit dans le langage familier français pour dire la même chose et par extension, pour une personne qui a trop de choses à faire.

Fini la digression :p.

1) Il manque la fonction thiol (-SH) ou anciennement mercaptan.
2) Ok
3) Juste mais non justifié. C'est quoi la D-Cysteïne (en nomenclature officielle) ? Mais je dois bien admettre que c'est bizarre comme question.
4) Faux. Tu as fait des erreurs au niveau de la cystéïne (ou est le thiol par exemple).
5) Ok
6) Non, c'est quoi R ?

Comprends tu vraiment ce que tu écris ?
Si vous cherchez une correction, précisez le s'il vous plait.
CQFD : Ce Qu'il Fallait Démonter, app : appartient, sqrt = square root = racine carré. Par avance : Errare humanum est, perseverare diabolicum
Les sciences n'essaient pas d'expliquer ; c'est tout juste si elles tentent d'interpréter ; elles font essentiellement des modèles. Par modèle, on entend une construction mathématique qui, à l'aide de certaines interprétations verbales, décrit les phénomènes observés. La justification d'une telle construction mathématique réside uniquement et précisément dans le fait qu'elle est censée fonctionner.    -+- Johann von Neumann -+-

#5 Su Princess

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Posté 04 décembre 2011 - 16:28

Bonjour Boltzmann

Vous savez, je ne fais qu'appliquer mon cours, et comme je vous l'ai déjà dit, je fais tout mon possible pour comprendre la physique-chimie.
J'ai appris le tableau avec toutes les les formules chimiques des acides aminés naturels constitutifs des protéines.
Et pour la quesiton 3, on demande simplement de dessiner la configuration de la D-cystéine (de Fischer). C'est ce que j'ai fait car dans mon tableau, la formule de la cystéine est : HS-H2C-CH-COOH (avec NH2 en bas de CH).
Comme c'est une configuration en D, NH2 doit être placé à droite.
Je ne comprends pas pourquoi ma forumle chimique est fausse.

Pour la question 1, les seules groupes fonctionnels que j'ai appris pour former un dipeptide sont le groupe caractéristique acide et amine.

Pour la 4, justement c'est le thiol qui m'embête, dans une synthèse peptidique, où pourra t-on le mettre? En dessous de CH3 ?

Pour la dernière question, j'ai appliqué mon cours, la formule générale des acides -aminés est celle que je viens de mettre.
Je sais qu'on me demande la formule semi-développées, mais je n'en ai aucune idée. Comment les transformer.

Mais qu'en pensez-vous, c'est mieux essayer de répondre plutôt que de laisser la place vide. Je suis sincère et j'ai fait de mon mieux.

#6 Boltzmann_Solver

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Posté 04 décembre 2011 - 16:36

Bonjour Su,

Je repasserai ce soir pour te répondre. Mais pour la première question, tu as raison. J'ai mal lu la question. En effet, les fonctions servant à la formation de la liaison peptide sont la fonction amine et acide carboxylique (n'oublie pas carboxylique).

Si tu peux scanne moi ton cours en me précisant le niveau. Parce que les stéréodescripteur R et S ne sont au programme que des STL Chimie en principe.
Si vous cherchez une correction, précisez le s'il vous plait.
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#7 Su Princess

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Posté 04 décembre 2011 - 17:15

D'accord, mais je pense que je n'ai pas le droit de scanner mon cours ici, je vous enverrai un MP.
Merci

#8 Boltzmann_Solver

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Posté 04 décembre 2011 - 20:31

Ton cours m'a aidé à comprendre comment on vous fait aborder la notion. Et en effet, tu n'a jamais entendu parler de stéréodescripteur en dehors de L/D (d'ailleurs, je trouve ce cours assez mal fait dans le sens où R/S est plus facile à assimiler que L/D, enfin bon).

Pour 4), il y a deux erreurs, tu n'as pas mis le -SH à droite de la liaison peptide et tu as oublié une CH3 à droite de la liaison peptide.
Pour 6), il suffit de rompre la liaison peptide. C'est à dire, tu "casses" la liaison C-N sur le carbone où il y a le carbonyle. Ensuite, tu reformes l'acide carboxylique d'un coté et l'amine de l'autre.

On te donne une formule générale. C'est à dire, qu'il faut remplacer correctement R.

PS : j'imagine que tu es en SMS ?
Si vous cherchez une correction, précisez le s'il vous plait.
CQFD : Ce Qu'il Fallait Démonter, app : appartient, sqrt = square root = racine carré. Par avance : Errare humanum est, perseverare diabolicum
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#9 Su Princess

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Posté 05 décembre 2011 - 10:04

Bonjour
J'ai rectifié mes erreurs, donc pour la réponse 3 j'ai bien justifié ma réponse non?
Pour la 4 c'est ça:
Image IPB





et pour la 6 c'est ça:
Image IPB

#10 Su Princess

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Posté 06 décembre 2011 - 13:14

PS: Oui, plus précisément en ST2S.
Comment le savez-vous?

#11 Su Princess

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Posté 06 décembre 2011 - 14:12

Mais vous savez, on apprend la forme R et la forme T en biologie et physiopathologie humaines.

#12 Su Princess

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Posté 22 décembre 2011 - 11:42

Heureusement que j'ai compris, je n'ai pas laissé tomber cet exercice et on m'a tout expliqué.

#13 Boltzmann_Solver

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Posté 22 décembre 2011 - 11:44

Voir le messageSu Princess, le 22 décembre 2011 - 11:42, dit :

Heureusement que j'ai compris, je n'ai pas laissé tomber cet exercice et on m'a tout expliqué.

J'en suis ravi pour toi. Je n'ai plus eu le temps, désolé.
Si vous cherchez une correction, précisez le s'il vous plait.
CQFD : Ce Qu'il Fallait Démonter, app : appartient, sqrt = square root = racine carré. Par avance : Errare humanum est, perseverare diabolicum
Les sciences n'essaient pas d'expliquer ; c'est tout juste si elles tentent d'interpréter ; elles font essentiellement des modèles. Par modèle, on entend une construction mathématique qui, à l'aide de certaines interprétations verbales, décrit les phénomènes observés. La justification d'une telle construction mathématique réside uniquement et précisément dans le fait qu'elle est censée fonctionner.    -+- Johann von Neumann -+-

#14 Su Princess

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Posté 22 décembre 2011 - 11:48

Ah ce n'est pas grave, le plus important est que j'ai compris. Merci pour tout.




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